近日，我院AI for Science团队师资博士后杨钰宁与吉林大学李向涛教授、多伦多大学张兆雷教授合作在《Advanced Science》期刊发表SCI论文“Deciphering 3’UTR Mediated Gene Regulation Using Interpretable Deep Representation Learning”。

期刊简介： Advanced Science 是一本跨学科的高质量期刊，涵盖材料科学、物理学和化学、医学和生命科学以及工程学的基础和应用研究。该期刊以创新性、前沿性和高质量的研究成果为特色，通过严格的评审流程筛选出高质量研究成果，并采用高水平的制作标准进行出版，旨在为广大读者提供最新、最有价值的科学成果。

期刊类别：中国科学院大类学科一区TOP期刊（影响因子：14.3）

作者顺序：杨钰宁，李根，庞宽，曹吴新昊，张兆雷，李向涛

通讯作者：李向涛（吉林大学），张兆雷（加拿大多伦多大学）

论文概述：信使 RNA 的 3’非翻译区（3’UTR）包含许多关键的顺式调控元件，这些元件在功能和进化上受到严格限制，类似于人类语言中的语法结构。因此，本研究借助先进的自然语言处理技术，以无监督的方式在海量调控序列上进行建模，并应用于特定的下游任务，例如识别RBP 结合位点、m6A 修饰位点和预测RNA亚细胞定位。基准测试结果表明，3UTRBERT 在这些任务上均优于当前多个最先进的精确算法。同时，3UTRBERT 的自注意力机制能够直观展示序列元素之间的语义关系，准确识别出具有重要调控功能的区域，为深入理解转录后调控机制提供帮助。

初审：武珊

复审：周治国

终审：殷明浩